“灵影”MPI&CT客户端

2022-10-09 V3.1.202409 215 胡朝恩, 惠辉(中国科学院自动化研究所)


1.  安装环境

系统:windows7 及以上64位系统
内存:16GB
硬盘:128GB
显卡:支持cuda计算的显卡,显存6GB以上

2.  基本功能

  • 支持DICOM文件读取保存,支持raw文件的读取和保存;
  • 多体数据3维融合显示,多体数据2d三视图可视化;
  • 多体融合交互调整、感兴趣区域交互标定;
  • 统计数据表格导出、GIF动画导出。

3.  示例

       示例中数据由冯欣博士提供

4.  操作手册

http://mpilab.net/zh-hans/support/1/docs/

5. 引用

CT&MPI Visualization tools. V2.2. October 2022. Key Laboratory of Molecular Imaging, Chinese Academy of Sciences. http://mpilab.net/toolkits/. 28/11/2022.

CT 重建命令行程序工具

2022-03-08 1.0.0 23 胡朝恩, 惠辉(中国科学院自动化研究所)


用法: D:\code\bin\rec.exe [options] path
可选参数:
-d, --save-as-dicom              保存为Dicom序列(默认为Raw).
-o, --out-directory <directory>  保存结果到 <directory>.

参数:
path                             ini所在文件夹路径或ini文件路径

 注意事项

  • 把压缩包解压到指定目录下
  • 双击运行 “添加到用户环境PATH.bat”把rec.exe所在目录添加到系统环境目录
  • 提示缺少dll,运行 “vc_redist.x64.exe”
  • windows  64位系统,支持cuda的显卡
  • 标准的ini参考"1.ini", 后面参考这个生成

1. 自动检索路径下的投影数据进行重建

# 目的:检索D:\data\data\下所有投影数据进行重建,并保存Raw格式到D:\data\
rec.exe D:\data\data\ -o D:\data\  
# 目的:检索D:\data\data\下所有投影数据进行重建,并保存Dicom 格式到D:\data\
rec.exe -d D:\data\data\ -o D:\data\    

2. 指定投影数据配置文件(*.ini) 进行重建

# 重建后保存为Dicom格式,保存到 D:\data\
rec.exe -d D:\data\data\298474\1.ini -o D:\data\

终端识别不到rec.exe 命令,双击运行 “添加到用户环境PATH.bat”;注销用户,重新登录即可;从环境中移除请双击运行“从用户环境PATH删除.bat”;